6月 10 日，北京 — 安捷倫科技公司宣布更新其新型 SurePrint 基因表達(dá)微陣列芯片用于人、小鼠和大鼠模型的信使 RNA 分析應(yīng)用。此次更新改進(jìn)了編碼和非編碼內(nèi)容，為研究人員提供在常用平臺上研究表達(dá)模式的z*新工具。
安捷倫公司與根特大學(xué)合作開發(fā)了z*新款旗艦版 SurePrint G3 人基因表達(dá) v3 微陣列芯片，其中完整包含的 LNCipedia 2.1 數(shù)據(jù)庫能夠?qū)﹂L鏈非編碼 RNA (lncRNA) 轉(zhuǎn)錄物進(jìn)行可靠分析。
LncRNA（長度大于 200 個核苷酸的非編碼 RNA）能夠通過直接作用于 DNA、RNA 和蛋白質(zhì)而改變基因調(diào)控，從而實(shí)現(xiàn)靶標(biāo)特異性或系統(tǒng)范圍內(nèi)的調(diào)控。 通過 lncRNA 與癌癥、心血管疾病和神經(jīng)退行性疾病的關(guān)聯(lián)不難看出其廣范卻至關(guān)重要的作用。
經(jīng)重新設(shè)計的安捷倫基因表達(dá)微陣列芯片是高質(zhì)量的特征捕獲工具，可實(shí)現(xiàn)目標(biāo)基因或通路的有效分析，涉及從協(xié)助疾病危險分層到闡明藥物作用機(jī)制的各種應(yīng)用。
根特大學(xué)的 Jo Vandesompele 教授說：“我們與安捷倫密切合作設(shè)計了一流的 mRNA 和 lncRNA 表達(dá)分析方法。在單次分析中對這兩種類型的RNA進(jìn)行的同時測定有助于從相對基因表達(dá)水平深入探究mRNA與lncRNA之間的生物學(xué)聯(lián)系。 其中的關(guān)鍵在于實(shí)現(xiàn)編碼和長鏈非編碼特征的良好平衡，而LNCipedia 2.1 則是與安捷倫基因表達(dá)內(nèi)容配對的z*佳數(shù)據(jù)源。微陣列芯片的z*終設(shè)計經(jīng)優(yōu)化后可快速給出大量有價值的信息。”
z*新的微陣列芯片采用能夠?qū)崿F(xiàn)寡核苷酸精確合成的 SurePrint 技術(shù)制造。 SurePrint 微陣列芯片的靈敏度處于業(yè)內(nèi)領(lǐng)先水平，具有5 個數(shù)量級以上的動態(tài)范圍以及 5% 的陣列間變異系數(shù)中值，且在 R2>0.95 時與外部 RNA 對照聯(lián)盟 (External RNA Controls Consortium) 的加標(biāo) RNA 對照品相比具有出色的定量一致性。
“我們的 SurePrint 基因表達(dá)微陣列芯片不僅包含 LNCipedia 的 lncRNA 等嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膶I(yè)內(nèi)容，還能夠?yàn)閷＜壹売脩籼峁╈`活的定制服務(wù)。”安捷倫基因組學(xué)高級總監(jiān) Alessandro Borsatti 博士談道， “憑借基因表達(dá)微陣列芯片的出色性能和定量一致性以及 RNA 測序和靶向序列捕獲產(chǎn)品，我們能夠使研究人員在微陣列芯片的篩查應(yīng)用與更深度的二代測序的發(fā)現(xiàn)性應(yīng)用之間實(shí)現(xiàn)完美轉(zhuǎn)換。”
SurePrint 基因表達(dá)微陣列芯片屬于 SurePrint 產(chǎn)品系列，該系列包括 microRNA 與比較基因組雜交微陣列芯片。 安捷倫基因組學(xué)工作流程包括用于質(zhì)量控制的 2100 生物分析儀和 2200 Tapestation、用于數(shù)據(jù)采集的SureScan 掃描儀、用于數(shù)據(jù)分析的 GeneSpring 軟件，以及用于進(jìn)行實(shí)時聚合酶鏈反應(yīng)的 AriaMX 系統(tǒng)。
